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抗体-药物缀合物的敏感性标志物的制作方法

文档序号:24891618发布日期:2021-04-30 13:18
抗体-药物缀合物的敏感性标志物的制作方法
本发明涉及一种鉴定要给予含有抗体-药物缀合物的药物的受试者的方法,其中所述受试者是患有癌症的人患者。
背景技术
:大多数抗癌剂对某些人患者是有效的,但是对其它人患者是无效的。这是基于癌症的遗传多样性,并且甚至可能在相同患者内的癌症之间观察到这样的差异。在患者之间药物效力的差异在分子靶向抗癌剂中是特别显著的。因而需要适当测试来确定哪种抗癌剂对哪位患者是有效的。在没有这样的测试时,不可预见抗癌剂将充分地发挥其作用。已经建立了基于敏感性标志物发现的诊断方法,其预先鉴定可能对新抗癌剂具有临床应答的患者,由此加速药剂的开发。这使得可能显著地减小临床研究的规模、时段和成本。基因组学、蛋白组学或分子成像的技术已经允许敏感性标志物的快速且高灵敏度的检测。但是,尽管与癌症中的基因概述分析有关的各种技术已经变得可得到,似乎事实上没有抗癌剂的敏感性标志物的实际应用被广泛使用。上述的分子靶向抗癌剂的靶标的例子包括人trop2。人trop2(滋养层细胞表面蛋白2,tacstd2:肿瘤-相关的钙信号转导蛋白2,ga733-1,egp-1,m1s1;在下文中被称作htrop2)是由323个氨基酸残基组成的1型一次跨膜(one-transmembrane)细胞膜蛋白。使用临床样本的免疫组织化学分析已经显示,htrop2在多种的上皮细胞衍生的癌症中过表达,并且在正常组织中的表达限于几种组织的上皮细胞,且表达量在正常组织中低于在肿瘤组织中(非专利文献1-5)。还已经报道,htrop2的表达与结肠直肠癌(非专利文献1)、胃癌(非专利文献2)、胰腺癌(非专利文献3)、口癌(非专利文献4)和神经胶质瘤(非专利文献5)中的预后不良有关。此外,已经从使用结肠直肠癌细胞的模型报道,htrop2的表达参与免疫缺陷的小鼠中不依赖于支架的癌细胞的细胞增殖和肿瘤形成(非专利文献6)。从这样的提示与癌症的关联的信息,迄今为止已经建立了多种抗-htrop2抗体,并已经研究了它们的抗肿瘤作用。公开了这样的抗-htrop2抗体包括作为单独抗体在nu/nu小鼠异种移植物模型中表现出抗肿瘤活性的抗体(专利文献1-4),和作为抗体-药物缀合物表现出抗肿瘤活性的抗体(专利文献5-7)。但是,这些的活性强度和应用范围仍然是不充分的,并且存在通过选择htrop2作为治疗靶标可以解决的未得到满足的医学需要。现有抗体或抗体-药物缀合物没有满足医学需要的原因包括,不仅因为它们作为药物不是充分有效的,而且因为尚未发现合适的敏感性标志物。例如,已知的是,仅通过htrop2的表达量不能预见靶向htrop2的抗体-药物缀合物在小细胞肺癌中表现出的抗肿瘤活性(非专利文献7)。可以预见到抗体-药物缀合物(在下文中,有时称作“adc”)(其中细胞毒性的药物缀合至结合在癌细胞表面上表达的抗原的抗体且能够被内化进细胞中)将药物选择性地递送至癌细胞,在癌细胞中积累药物,并杀死癌细胞。这样的抗体-药物缀合物的一种已知例子是包括抗体和依沙替康(它是一种拓扑异构酶i抑制剂)的衍生物作为其组分的抗体-药物缀合物(专利文献9-15,非专利文献8-16)。在专利文献9中描述的抗体-药物缀合物包括抗-htrop2抗体且能够杀死表达htrop2抗体的癌细胞。但是,与靶向htrop2的现有抗体或抗体-药物缀合物类似,通过单独的htrop2的表达量不可准确地预测所述抗体-药物缀合物的抗肿瘤活性。人slfn11(schlafen家族成员11)是由901个氨基酸残基组成的蛋白,且已经提示其具有响应于dna复制应激而结合复制叉和抑制dna复制的功能(非专利文献17)。还已经报道,癌细胞系对破坏dna的抗癌剂(包括拓扑异构酶i抑制剂)的敏感性与slfn11的mrna表达量高度相关(非专利文献18-19)。还已知的是,维利帕尼、聚adp核糖聚合酶(parp)抑制剂和rovalpituzumabtesirine(rova-t)(一种抗-dll3抗体-药物缀合物)的组合对于具有高表达slfn11的小细胞肺癌的患者提供了存活益处(非专利文献20)。此外,已知的是,烷化剂替莫唑胺和维利帕尼的组合对于具有高表达slfn11的小细胞肺癌的患者提供了存活益处(非专利文献21)。但是,尚未阐明使用拓扑异构酶i抑制剂诸如依沙替康的adc的抗肿瘤活性与slfn11的表达量之间的关联,且其作为用于预测药物效力的诊断剂的有效性是不清楚的。引文列表专利文献专利文献1:wo2008/144891专利文献2:wo2011/145744专利文献3:wo2011/155579专利文献4:wo2013/077458专利文献5:wo2003/074566专利文献6:wo2011/068845专利文献7:wo2013/068946专利文献8:美国专利号7999083专利文献9:wo2014/057687专利文献10:wo2014/061277专利文献11:wo2015/098099专利文献12:wo2015/115091专利文献13:wo2015/146132专利文献14:wo2015/155976专利文献15:wo2015/155998非专利文献非专利文献1:ohmachit,等人,clin.cancerres.,12(10),3057-3063(2006)非专利文献2:muhlmanng,等人,j.clin.pathol.,62(2),152-158(2009)非专利文献3:fongd,等人,br.j.cancer,99(8),1290-1295(2008)非专利文献4:fongd,等人,mod.pathol.,21(2),186-191(2008)非专利文献5:nings,等人,neurol.sci.,34(10),1745-1750(2013)非专利文献6:wangj,等人,mol.cancerther.,7(2),280-285(2008)非专利文献7:grayj.e.,等人.clin.cancerres.23(19),5711-5719(2017)非专利文献8:ducry,l.,等人,bioconjugatechem.(2010)21,5-13非专利文献9:alley,s.c.,等人,currentopinioninchemicalbiology(2010)14,529-537非专利文献10:damlen.k.expertopin.biol.ther.(2004)4,1445-1452非专利文献11:senterp.d.,等人,naturebiotechnology(2012)30,631-637非专利文献12:howarda.等人,jclinoncol29:398-405非专利文献13:ogitaniy.等人,clinicalcancerresearch(2016)22(20),5097-5108非专利文献14:ogitaniy.等人,cancerscience(2016)107,1039-1046非专利文献15:doit,等人,lancetoncol2017;18:1512-22非专利文献16:takegawan,等人,int.j.cancer:141,1682-1689(2017)非专利文献17:muraij,等人,mol.cell69(3),371-384(2018)非专利文献18:zoppolig,等人,proc.natl.acad.sci.u.s.a.,109(37):15030-15035(2012)非专利文献19:barretinaj,等人,nature483(7391),603-607(2012)非专利文献20:vandenborgr,等人,expertrev.anticancerther.,19(6),461-471(2019)非专利文献21:pietanzamc,等人,j,clin.oncol.36(23),2386-2394(2018)。技术实现要素:技术问题本发明涉及使用mrna水平的基因表达作为指标,鉴定要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者的方法,其中受试者是患有癌症的人患者。问题的解决方案本发明的发明人已经发现,组合的htrop2基因和slfn11基因在mrna水平的表达量能够更准确地鉴定要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,并完成了本发明。也就是说,本发明包括下述条款中的每一项,但不限于此。[1]一种用于鉴定要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者的方法,其中所述受试者是患有癌症的人患者,所述方法包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价htrop2基因在mrna水平的表达量;3)在生物样品中评价slfn11基因在mrna水平的表达量,其中所述生物样品是被确定为具有htrop2基因的高表达量的生物样品;和4)将提供所述生物样品的人患者鉴定为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有slfn11基因的高表达量的生物样品。[2]一种用于鉴定要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者的方法,其中所述受试者是患有癌症的人患者,所述方法包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价htrop2基因和slfn11基因在mrna水平的表达量;和3)将提供所述生物样品的人患者鉴定为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有htrop2基因和slfn11基因的高表达量的生物样品。[3]根据[1]或[2]的方法,其中通过对得自诊断为患有癌症的人患者的生物样品进行rna测序,测量log2[rpkm+1]值,并当log2[rpkm+1]值超过特定值时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因和/或slfn11基因在mrna水平的高表达量。[4]根据[3]的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过选自6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8.0、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9和9.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[5]根据[3]或[4]的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过选自6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9和8.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[6]根据[3]至[5]中的任一项的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过选自6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9和8.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[7]根据[3]至[6]中的任一项的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过选自7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9和8.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[8]根据[3]至[7]中的任一项的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过选自7.5、7.6、7.7、7.8、7.9和8.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[9]根据[3]至[7]中的任一项的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过选自7.0、7.5和8.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[10]根据[9]的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过7.0时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[11]根据[9]的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过7.5时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[12]根据[9]的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过8.0时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[13]根据[3]至[12]中的任一项的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过选自1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9和4.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[14]根据[3]至[13]中的任一项的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过选自1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9和3.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[15]根据[3]至[14]中的任一项的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过选自2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9和3.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[16]根据[3]至[14]中的任一项的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过选自1.0、2.0和3.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[17]根据[16]的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过1.0时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[18]根据[16]的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过2.0时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[19]根据[16]的方法,其中当log2[rpkm+1]值超过3.0时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[20]根据[1]或[2]的方法,其中通过对得自诊断为患有癌症的人患者的生物样品进行rna测序,测量log2[fpkm+1]值,并当log2[fpkm+1]值超过特定值时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因和/或slfn11基因在mrna水平的高表达量。[21]根据[20]的方法,其中当log2[fpkm+1]值超过选自6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9和8.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[22]根据[20]或[21]的方法,其中当log2[fpkm+1]值超过选自6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9和7.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[23]根据[20]或[21]的方法,其中当log2[fpkm+1]值超过6.0或7.0时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[24]根据[22]的方法,其中当log2[fpkm+1]值超过6.0时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[25]根据[22]的方法,其中当log2[fpkm+1]值超过7.0时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[26]根据[20]至[25]中的任一项的方法,其中当log2[fpkm+1]值超过选自2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9和4.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[27]根据[20]至[26]中的任一项的方法,其中当log2[fpkm+1]值超过选自2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9和3.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[28]根据[22]至[26]中的任一项的方法,其中当log2[fpkm+1]值超过2.0或3.0时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[29]根据[28]的方法,其中当log2[fpkm+1]值超过2.0时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[30]根据[28]的方法,其中当log2[fpkm+1]值超过3.0时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[31]根据[1]或[2]的方法,其中通过对得自诊断为患有癌症的人患者的生物样品进行edgeseq测定,测量log2[mnc+1]值,并当log2[mnc+1]值超过特定值时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因和/或slfn11基因在mrna水平的高表达量。[32]根据[31]的方法,其中当log2[mnc+1]值超过选自12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0.13.1、13.2、13.3、13.4、13.5、13.6、13.7、13.8、13.9、14.0、14.1、14.2、14.3、14.4、14.5、14.6、14.7、14.8、14.9和15.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[33]根据[31]或[32]的方法,其中当log2[mnc+1]值超过选自12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0.13.1、13.2、13.3、13.4、13.5、13.6、13.7、13.8、13.9和14.0的任一个时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[34]根据[31]或[32]的方法,其中当log2[mnc+1]值超过12.0、13.0或14.0时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[35]根据[34]的方法,其中当log2[mnc+1]值超过12.0时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[36]根据[34]的方法,其中当log2[mnc+1]值超过13.0时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[37]根据[34]的方法,其中当log2[mnc+1]值超过14.0时,将所述生物样品确定为具有htrop2基因在mrna水平的高表达量。[38]根据[31]至[37]中的任一项的方法,其中当log2[mnc+1]值超过选自11.5、11.6、11.7、11.8、11.9、12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0、13.1、13.2、13.3、13.4和13.5的任一个时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[39]根据[31]至[38]中的任一项的方法,其中当log2[mnc+1]值超过选自11.5、11.6、11.7、11.8、11.9、12.0、12.1、12.2、12.3、12.4和12.5的任一个时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[40]根据[31]至[38]中的任一项的方法,其中当log2[mnc+1]值超过选自11.5、12.0和12.5的任一个时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[41]根据[40]的方法,其中当log2[mnc+1]值超过11.5时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[42]根据[40]的方法,其中当log2[mnc+1]值超过12.0时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[43]根据[40]的方法,其中当log2[mnc+1]值超过12.5时,将所述生物样品确定为具有slfn11基因在mrna水平的高表达量。[44]根据[1]至[43]中的任一项的方法,其中所述生物样品包括肿瘤样品。[45]根据[1]至[44]中的任一项的方法,其中所述含有抗-htrop2抗体的药物是抗-htrop2抗体-药物缀合物。[46]根据[45]的方法,其中所述抗-htrop2抗体-药物缀合物是抗体-药物缀合物,其中药物-接头由下式表示:[式1]其中a代表与抗-htrop2抗体的连接位置,且抗-htrop2抗体通过硫醚键彼此缀合。[47]根据[46]的方法,其中所述抗-htrop2抗体是由以下组成的抗体:由seqidno:1的氨基酸残基20-470组成的氨基酸序列所组成的重链和由seqidno:2的氨基酸残基21-234组成的氨基酸序列所组成的轻链。[48]根据[47]的方法,其中在抗-htrop2抗体的重链的羧基端处的赖氨酸残基被缺失。[49]根据[46]至[48]中的任一项的方法,其中每个抗体分子缀合的药物-接头的平均单元数目是在2-8范围内。[50]根据[46]至[49]中的任一项的方法,其中每个抗体分子缀合的药物-接头的平均单元数目是在3.5-4.5范围内。[51]根据[45]的方法,其中所述抗-htrop2抗体-药物缀合物是sacituzumabgovitecan(immu-132)。[52]根据[1]至[51]中的任一项的方法,其中所述癌症是肺癌、肾癌、泌尿道上皮癌、结肠直肠癌、前列腺癌、多形胶质母细胞瘤、卵巢癌、胰腺癌、乳腺癌、黑素瘤、肝癌、膀胱癌、胃癌、宫颈癌、子宫癌、头颈癌、食管癌、胆道癌、甲状腺癌、淋巴瘤、急性髓性白血病、急性淋巴样白血病和/或多发性骨髓瘤。本发明还包括下述条款。应当指出,[3]至[52]的构型或要求也可以应用于以下发明。[53]一种用于鉴定要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者的方法,其中所述受试者是患有癌症的人患者,所述方法包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价htrop2基因和/或slfn11基因在mrna水平的表达量;和3)将提供所述生物样品的人患者鉴定为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有htrop2基因和/或slfn11基因的高表达量的生物样品。[54]一种用于鉴定要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者的方法,其中所述受试者是患有癌症的人患者,所述方法包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价htrop2基因在mrna水平的表达量;和3)将提供所述生物样品的人患者鉴定为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有htrop2基因的高表达量的生物样品。[55]一种用于鉴定要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者的方法,其中所述受试者是患有癌症的人患者,所述方法包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价slfn11基因在mrna水平的表达量;和3)将提供所述生物样品的人患者鉴定为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有slfn11基因的高表达量的生物样品。[56]一种用于鉴定要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者的方法,其中所述受试者是患有癌症的人患者,所述方法包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价htrop2基因和slfn11基因在mrna水平的表达量;和3)将提供所述生物样品的人患者鉴定为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有htrop2基因和slfn11基因的高表达量的生物样品。[57]一种用于鉴定要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者的方法,其中所述受试者是患有癌症的人患者,所述方法包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价htrop2基因在mrna水平的表达量;3)在生物样品中评价slfn11基因在mrna水平的表达量,其中所述生物样品是被确定为具有htrop2基因的高表达量的生物样品;和4)将提供所述生物样品的人患者鉴定为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有slfn11基因的高表达量的生物样品。[58]一种用于鉴定要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者的方法,其中所述受试者是患有癌症的人患者,所述方法包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价slfn11基因在mrna水平的表达量;3)在生物样品中评价htrop2基因在mrna水平的表达量,其中所述生物样品是被确定为具有slfn11基因的高表达量的生物样品;和4)将提供所述生物样品的人患者鉴定为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有htrop2基因的高表达量的生物样品。[59]一种用于治疗癌症的方法,所述方法包括施用含有抗-htrop2抗体的药物,所述方法进一步包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价htrop2基因在mrna水平的表达量;3)在生物样品中评价slfn11基因在mrna水平的表达量,其中所述生物样品是被确定为具有htrop2基因的高表达量的生物样品;和4)选择提供所述生物样品的人患者作为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有slfn11基因的高表达量的生物样品。[60]一种用于治疗癌症的方法,所述方法包括施用含有抗-htrop2抗体的药物,所述方法进一步包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价htrop2基因和slfn11基因在mrna水平的表达量;和3)选择提供所述生物样品的人患者作为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有htrop2基因和slfn11基因的高表达量的生物样品。[61]一种用于治疗癌症的方法,所述方法包括施用含有抗-htrop2抗体的药物,所述方法进一步包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价htrop2基因和/或slfn11基因在mrna水平的表达量;和3)选择提供所述生物样品的人患者作为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有htrop2基因和/或slfn11基因的高表达量的生物样品。[62]一种用于治疗癌症的方法,所述方法包括施用含有抗-htrop2抗体的药物,所述方法进一步包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价htrop2基因在mrna水平的表达量;和3)选择提供了所述生物样品的人患者作为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有htrop2基因的高表达量的生物样品。[63]一种用于治疗癌症的方法,所述方法包括施用含有抗-htrop2抗体的药物,所述方法进一步包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价slfn11基因在mrna水平的表达量;和3)选择提供所述生物样品的人患者作为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有slfn11基因的高表达量的生物样品。[64]一种用于治疗癌症的方法,所述方法包括施用含有抗-htrop2抗体的药物,所述方法进一步包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价htrop2基因和slfn11基因在mrna水平的表达量;和3)选择提供了所述生物样品的人患者作为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有htrop2基因和slfn11基因的高表达量的生物样品。[65]一种用于治疗癌症的方法,所述方法包括施用含有抗-htrop2抗体的药物,所述方法进一步包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价htrop2基因在mrna水平的表达量;3)在生物样品中评价slfn11基因在mrna水平的表达量,其中所述生物样品是被确定为具有htrop2基因的高表达量的生物样品;和4)选择提供了所述生物样品的人患者作为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有slfn11基因的高表达量的生物样品。[66]一种用于治疗癌症的方法,所述方法包括施用含有抗-htrop2抗体的药物,所述方法进一步包括:1)从诊断为患有癌症的人患者获得生物样品;2)在所述生物样品中评价slfn11基因在mrna水平的表达量;3)在所述生物样品中评价htrop2基因在mrna水平的表达量,其中所述生物样品是被确定为具有slfn11基因的高表达量的生物样品;和4)选择提供了所述生物样品的人患者作为要给予含有抗-htrop2抗体的药物的受试者,其中所述生物样品是被确定为具有htrop2基因的高表达量的生物样品。发明的有利效果对将给予含有抗htrop2抗体的药物的受试者的鉴定使得能够选择预期所述药物对其有作用的患者和将药物施用给患者。附图简要说明[图1]图1显示了人源化的抗-htrop2抗体的重链的氨基酸序列(seqidno:1)。[图2]图2显示了人源化的抗-htrop2抗体的轻链的氨基酸序列(seqidno:2)。[图3]图3显示了人源化的抗-htrop2抗体的重链的cdrh1序列(seqidno:3)、cdrh2序列(seqidno:4)和cdrh3序列(seqidno:5),以及人源化的抗-htrop2抗体的轻链的cdrl1序列(seqidno:6)、cdrl2序列(seqidno:7)和cdrl3序列(seqidno:8)。[图4]图4的简图显示了在slfn11敲低后化合物(1)和抗体-药物缀合物(1)在fadu细胞中的细胞增殖抑制作用。[图5]图5的简图显示了在slfn11敲低后化合物(1)和抗体-药物缀合物(1)在nci-h1781细胞中的细胞增殖抑制作用。[图6]图6的简图显示了在slfn11敲低后化合物(1)和抗体-药物缀合物(1)在calu-3细胞中的细胞增殖抑制作用。[图7]图7的简图显示了在slfn11敲低后化合物(1)和抗体-药物缀合物(1)在mda-mb-468细胞中的细胞增殖抑制作用。[图8]图8的简图显示了在slfn11敲低后化合物(1)和抗体-药物缀合物(1)在hcc38细胞中的细胞增殖抑制作用。实施方案的描述定义在本说明书中,除非另外指出,否则当提及数值时,“约”是指指定的数值的±10%。在本说明书中,“癌症”和“肿瘤”互换使用。在本说明书中,术语“基因”不仅包括dna,而且包括其mrna、cdna和crna。在本说明书中,术语“多核苷酸”以与核酸相同的含义使用,且包括dna、rna、探针、寡核苷酸和引物。在本说明书中,“多肽”和“蛋白”没有差别地使用。在本说明书中,“细胞”包括单个动物中的细胞和培养的细胞。在本说明书中,“htrop2”是指由通过nm_002353(ncbi)的登录号标识的基因及其等位基因变体编码的人蛋白,且包括通过np_002344(ncbi)标识的蛋白。在本说明书中,“slfn11”是指由通过nm_152270(ncbi)的登录号标识的基因及其等位基因变体编码的人蛋白,且包括通过np_689483(ncbi)标识的蛋白。在本说明书中,“抗体的抗原结合片段”是指对抗原具有结合活性的抗体的部分片段,且包括fab、f(ab)2、fv、scfv、双体、直链抗体、从抗体片段形成的多特异性抗体等。通过在还原条件下处理f(ab)2而得到的fab(抗体的可变区的单价片段)也被包括在抗体的抗原结合片段中。但是,抗体的抗原结合片段不限于这些分子,只要所述片段具有结合抗原的能力。抗原结合片段还不仅包括通过用适当的酶处理抗体蛋白的全长分子而得到的片段,而且包括使用遗传工程改造的抗体基因在适当的宿主细胞中生产的蛋白。在本说明书中,“cdr”是指互补性决定区(cdr)。已知的是,抗体分子的重链和轻链中的每一个具有三个cdr。cdr也被称作高变区(高变结构域),并且存在于抗体的重链和轻链的可变区内。cdr是一级结构的可突变性特别高的位点,并在多肽链的一级结构中在重链和轻链中的每一个中分成三个部分。在本说明书中,对于抗体的cdr,重链的cdr从重链氨基酸序列的氨基端侧起指定为cdrh1、cdrh2、cdrh3,且轻链的cdr从轻链氨基酸序列的氨基端侧起指定为cdrl1、cdrl2、cdrl3。这些位点在所述抗体的构象中彼此靠近,并决定所述抗体要结合的抗原的特异性。在本说明书中,对治疗的“应答”是指,治疗的肿瘤显示出(a)增殖的延迟,(b)增殖的停止,或(c)消退。抗-htrop2抗体使用本领域中通常实践的方法,通过用htrop2或选自htrop2的氨基酸序列的任何多肽免疫动物,并收集和纯化在所述动物体中产生的抗体,可以得到在本发明中使用的针对htrop2的抗体。充当抗原的trop2的生物物种不限于人类,且从非人动物诸如小鼠或大鼠衍生出的trop2还可以用于免疫动物。在该情况下,通过测试得到的结合异源trop2的抗体与htrop2的交叉反应性,可以选择要应用于人疾病的抗体。根据已知方法(例如,kohler和milstein,nature(1975)256,第495-497页;kennet,r.编,monoclonalantibodies,第365-367页,plenumpress,n.y.(1980)),通过使生产htrop2抗体的抗体生产细胞与骨髓瘤细胞融合来建立杂交瘤,也可以得到单克隆抗体。应当指出,通过经遗传程序在宿主细胞中表达htrop2基因,可以得到充当抗原的htrop2。具体地,可以如下得到htrop2:制备能够表达htrop2基因的载体,将所述载体引入宿主细胞中以表达所述基因,并纯化表达的trop2。也可能使用通过上述遗传程序得到的表达htrop2的细胞或表达htrop2的细胞系作为htrop2蛋白。除了上述的针对htrop2的单克隆抗体以外,本发明的抗体还包括为了降低在人中的异种抗原性的目的而人工修饰的基因重组抗体,诸如嵌合抗体、人源化抗体或人抗体。这些抗体可以使用已知方法生产。人源化抗体的例子包括、但不限于由seqidno:1表示的重链氨基酸序列和由seqidno:2表示的轻链氨基酸序列所组成的人源化抗体。各种抗-htrop2抗体,例如,在wo2008/144891、wo2011/145744、wo2011/155579、wo2013/077458、wo2003/074566、wo2011/068845、wo2013/068946、美国专利号7999083或wo2015/098099中所描述的,可以用在本发明中。已知的是,在培养的哺乳动物细胞中生产的抗体的重链的羧基端处的赖氨酸残基被缺失(tsubaki等人,int.j.biol.macromol,139-147,2013)。但是,重链序列中的该缺失不会影响抗体的抗原结合能力和效应子功能(诸如补体激活或抗体依赖性的细胞毒性作用)。因而,具有在上述的重链的羧基端处的赖氨酸残基缺失的抗体也可以用在本发明中。在本发明中使用的抗-htrop2抗体还包括抗体的抗原结合片段。抗体的抗原结合片段的例子包括fab、f(ab)2、fv、通过用适当的接头连接重链和轻链fv而得到的单链fv(scfv)、双体或双抗体、直链抗体和从抗体片段形成的多特异性抗体。通过在还原条件下处理f(ab)2而得到的fab(抗体的可变区的单价片段)也被包括在抗体的片段中。在本发明中使用的抗-htrop2抗体还包括抗体的经修饰变体。经修饰变体是指通过化学地或生物地修饰本发明的抗体而得到的抗体。化学修饰变体的例子包括具有与氨基酸骨架结合的化学部分的变体,和用n-连接的或o-连接的碳水化合物链化学修饰的变体。生物修饰变体的例子包括进行翻译后修饰(例如,n-连接的或o-连接的糖基化、n-端或c-端加工、脱酰胺化、天冬氨酸的异构化、甲硫氨酸的氧化)的变体,和通过在原核宿主细胞中表达它而将甲硫氨酸残基添加至n-端的变体。在本发明中使用的抗-htrop2抗体还包括经标记以实现抗-htrop2抗体或htrop2的检测或分离的抗体,例如,具有酶标记、荧光标记或亲和力标记的经修饰变体。抗-htrop2抗体的这样的经修饰变体可用于改善抗体在血液中的稳定性和保留,降低抗原性,检测或分离抗-htrop2抗体或htrop2等。通过调节在本发明中使用的抗-htrop2抗体所连接的糖链的修饰,例如,通过糖基化或去岩藻糖基化,也可能增强抗体依赖性的细胞毒性活性。用于修饰抗体的糖链的调节技术的例子包括、但不限于在wo1999/54342、wo2000/61739和wo2002/31140中描述的那些。在本发明中使用的抗-htrop2抗体还包括在其中调节糖链修饰的抗体。其它抗体本发明的方法也可以应用于含有除抗-htrop2抗体以外的结合抗原的抗体的药物。除了在本发明中使用的抗-htrop2抗体以外的抗体的例子包括,但不特别限于,抗-her2抗体、抗-her3抗体、抗-b7-h3抗体、抗-cd3抗体、抗-cd30抗体、抗-cd33抗体、抗-cd37抗体、抗-cd56抗体、抗-cd98抗体、抗-dr5抗体、抗-egfr抗体、抗-epha2抗体、抗-fgfr2抗体、抗-fgfr4抗体、抗-folr1抗体、抗-vegf抗体、抗-cd20抗体、抗-cd22抗体、抗-cd70抗体、抗-psma抗体、抗-cea抗体和抗-间皮素抗体、抗-a33抗体、抗-canag抗体、抗-cripto抗体、抗-g250抗体、抗-muc1抗体、抗-gpnmb抗体、抗-整联蛋白抗体、抗-腱糖蛋白-c抗体、抗-slc44a4抗体、抗-gpr20抗体和抗-cdh6抗体,优选抗-her2抗体、抗-her3抗体、抗-b7-h3抗体、抗-gpr20抗体和抗-cdh6抗体,更优选抗-her2抗体。每种抗体可以以与抗-htrop2抗体相同的方式得到。每种抗体也具有抗体通常具有的普遍性质,抗-htrop2抗体也是如此。在本发明中,“抗-her2抗体”表示特异性地结合her2(人表皮生长因子受体2型;erbb-2)且优选地具有通过结合her2而内化进her2表达细胞的活性的抗体。抗-her2抗体的例子包括曲妥珠单抗(美国专利号5821337)和培妥珠单抗(wo01/00245),优选曲妥珠单抗。在本发明中,“抗-her3抗体”表示特异性地结合her3(人表皮生长因子受体3型;erbb-3)且优选地具有通过结合her3而内化进her3表达细胞的活性的抗体。抗-her3抗体的例子包括patritumab(u3-1287)、u1-59(wo2007/077028)、mm-121(seribantumab)、在wo2008/100624中描述的抗-erbb3抗体、rg-7116(lumretuzumab)和ljm-716(elgemtumab),且优选patritumab和u1-59。在本发明中,“抗-b7-h3抗体”表示特异性地结合b7-h3(b细胞抗原#7同系物3;pd-l3;cd276)且优选地具有通过结合b7-h3而内化进b7-h3表达细胞的活性的抗体。抗-b7-h3抗体的例子包括m30-h1-l4(wo2014/057687)。在本发明中,“抗-gpr20抗体”表示特异性地结合gpr20(g蛋白偶联受体20)且优选地具有通过结合gpr20而内化进gpr20表达细胞的活性的抗体。抗-gpr20抗体的例子包括h046-h4e/l7(wo2018/135501)。在本发明中,“抗-cdh6抗体”表示特异性地结合cdh6(钙粘着蛋白-6)且优选地具有通过结合cdh6而内化进cdh6表达细胞的活性的抗体。抗-cdh6抗体的例子包括h01l02(wo2018/212136)。抗体-药物缀合物(1)在本发明中使用的抗体-药物缀合物是抗体-药物缀合物,其中药物-接头由下式表示:[式2]其中a代表与抗体的连接位置,且抗体通过硫醚键彼此缀合。在本发明中,由接头和药物组成的抗体-药物缀合物的部分结构被称作“药物-接头”。药物-接头缀合至在链间二硫键位点(在两个位置的重链之间,和在两个位置的重链和轻链之间)形成的巯基(换而言之,半胱氨酸残基的硫原子)。本发明的药物-接头包括依沙替康(iupac名称:(1s,9s)-1-氨基-9-乙基-5-氟-1,2,3,9,12,15-六氢-9-羟基-4-甲基-10h,13h-苯并[de]吡喃并[3,4:6,7]吲嗪并[1,2-b]喹啉-10,13-二酮,(也通过以下化学名称表示:(1s,9s)-1-氨基-9-乙基-5-氟-2,3-二氢-9-羟基-4-甲基-1h,12h-苯并[de]吡喃并[3,4:6,7]吲嗪并[1,2-b]喹啉-10,13(9h,15h)-二酮))(其为一种拓扑异构酶i抑制剂)作为组分。依沙替康是由下式表示的具有抗肿瘤作用的喜树碱衍生物:[式3]在本发明中使用的抗体-药物缀合物也可以用下式表示:[式4]在这里,药物-接头通过硫醚键缀合至抗体。n的含义与所谓的药物与抗体之比(dar)的含义相同,并表示每个抗体缀合的药物-接头的平均数目。可以在0-8且优选2-8的范围内调节在本发明中使用的抗体-药物缀合物的每个抗体缀合的药物-接头的平均数目。当抗体是抗-htrop2抗体时,缀合的药物-接头的平均数目更优选地是3-5,更优选地是3.5-4.5。在本发明所使用的抗体-药物缀合物被内化进癌细胞中以后,接头部分被切割,且由下式表示的化合物被释放:[式5]。认为以上化合物在本发明中使用的抗体-药物缀合物展现抗肿瘤活性中起主要作用。已经证实所述化合物具有拓扑异构酶i抑制作用(ogitaniy.等人,clinicalcancerresearch,2016,oct15;22(20):5097-5108,2016年3月29日电子公开)。可以应用本发明的方法,不限制被针对htrop2的抗体识别的抗原,只要抗体-药物缀合物释放以上化合物即可。拓扑异构酶i是通过切割和重组dna的单链、由此参与dna的合成而转化dna的高阶结构的酶。具有拓扑异构酶i抑制作用的药剂因而可以如下抑制癌细胞的增殖:抑制dna的合成,使细胞分裂停止在细胞周期的s期(dna合成期),和通过细胞凋亡诱导细胞死亡。应当指出,也已知在本发明中使用的抗体-药物缀合物具有旁观者效应(ogitaniy.等人,cancerscience(2016)107,1039-1046)。该旁观者效应基于以下事实而发挥:在本发明中使用的抗体-药物缀合物被内化进表达靶标的癌细胞中以后,以上化合物也对没有表达所述靶标的邻近癌细胞发挥抗肿瘤作用。在本发明中使用的抗体-药物缀合物的生产中所用的药物-接头中间体由下式表示:[式6]所述药物-接头中间体可以由化学名称n-[6-(2,5-二氧代-2,5-二氢-1h-吡咯-1-基)己酰基]甘氨酰甘氨酰-l-苯基丙氨酰基-n-[(2-{[(1s,9s)-9-乙基-5-氟-9-羟基-4-甲基-10,13-二氧代-2,3,9,10,13,15-六氢-1h,12h-苯并[de]吡喃并[3,4:6,7]吲嗪并[1,2-b]喹啉-1-基]氨基}-2-氧代乙氧基)甲基]甘氨酰胺表示,且可以参考wo2015/098099中的描述等生产。通过使上述的药物-接头中间体与具有巯基(也被称作硫氢基)的抗体反应,可以生产在本发明中使用的抗体-药物缀合物。通过本领域技术人员众所周知的方法(hermanson,g.t,bioconjugatetechniques,第56-136页,第456-493页,academicpress(1996)),可以得到具有巯基的抗体。例如,通过在含有螯合剂诸如乙二胺四乙酸(edta)的缓冲液中以抗体中每个链间二硫键0.3-3摩尔当量使还原剂诸如三(2-羧基乙基)膦盐酸盐(tcep)与抗体反应,可以得到具有巯基的抗体,其中抗体中的链间二硫键被部分地或完全地还原。此外,每个具有巯基的抗体使用2-20摩尔当量的药物-接头中间体,可以生产抗体-药物缀合物,其中每个抗体缀合了2-8个药物。可以确定每个生产的抗体-药物缀合物的抗体分子缀合的药物的平均数目,例如,通过包括在280nm和370nm的两个波长测量抗体-药物缀合物及其缀合前体的紫外吸光度的计算方法(紫外方法),或通过包括经由hplc测量来定量通过用还原剂处理抗体-药物缀合物而得到的每个片段的计算方法(hplc方法)。抗体和药物-接头中间体的缀合,和每个抗体-药物缀合物的抗体分子缀合的药物的平均数目的计算,可以参考wo2015/098099和wo2017/002776中的描述等进行。在本发明中使用的具有上述药物-接头的抗-htrop2抗体-药物缀合物的例子包括在wo2015/098099中描述的抗体-药物缀合物。应当指出,在wo2015/098099中描述的那些中的优选抗-htrop2抗体-药物缀合物包括由重链氨基酸序列和轻链氨基酸序列组成的抗体,所述重链氨基酸序列在重链可变区处含有由序列表的seqidno:3表示的氨基酸序列所组成的cdrh1(tagmq)、由seqidno:4表示的氨基酸序列所组成的cdrh2(winthsgvpkyaedfkg)和由seqidno:25表示的氨基酸序列所组成的cdrh3(sgfgssywyfdv),所述轻链氨基酸序列在轻链可变区处含有由序列表的seqidno:6表示的氨基酸序列所组成的cdrl1(kasqdvstava)、由seqidno:7表示的氨基酸序列所组成的cdrl2(sasyryt)和由seqidno:8表示的氨基酸序列所组成的cdrl3(qqhyitplt)。在wo2015/098099中描述的那些中的更优选的抗-htrop2抗体-药物缀合物包括由重链氨基酸序列和轻链氨基酸序列组成的抗体,所述重链氨基酸序列含有由seqidno:1表示的氨基酸序列的第20个至第140个氨基酸残基所组成的重链可变区,且所述轻链氨基酸序列含有由seqidno:2表示的氨基酸序列的第21个至第129个氨基酸残基所组成的轻链可变区。在wo2015/098099中描述的那些中的特别优选的抗-htrop2抗体-药物缀合物包括由seqidno:1表示的重链氨基酸序列和由seqidno:2表示的轻链氨基酸序列所组成的抗体。已知的是,在培养的哺乳动物细胞中生产的抗体的重链的羧基端处的赖氨酸残基被缺失。因而,上述的抗体-药物缀合物也包括具有在重链的羧基端处的赖氨酸残基缺失的抗体。但是,在本发明中使用的抗-htrop2抗体-药物缀合物不限于包括上述具体药物-接头的缀合物,只要其中所含的抗体识别htrop2即可。这样的抗-htrop2抗体-药物缀合物的例子包括sacituzumabgovitecan(immu-132)。在wo2003/074566、wo2011/068845、wo2013/068946或美国专利号7999083中描述的抗-htrop2抗体-药物缀合物也可以用在本发明中。生物样品从受试者(例如,诊断为患有癌症的受试者)收集的生物样品可以用作rna的来源,且可以确定在所述生物样品中在rna水平的基因表达水平。生物样品可以包括,例如,血液诸如全血或从血液衍生出的物质,例如,外核体、组织、细胞和/或来自组织的循环细胞。在一些实施方案中,所述生物样品可以取自肿瘤。外核体是由从细胞分泌的脂质双膜所组成的囊泡。从在二十世纪八十年代发现它们以来,迄今为止,众多研究已经显示,外核体在细胞之间转移并运输多种分子。由于它们的形态学特征,外核体包括许多生理学上有活性的分子诸如核酸、碳水化合物和脂质、以及蛋白。还已经揭示,外核体含有在细胞之间运输的mirna和mrna。因而,也可能选择外核体作为应用本发明的生物样品。通过已知方式,诸如静脉穿刺术,或使用已知的肿瘤活组织检查装置和程序,可以得到生物样品。本领域技术人员可以用于得到肿瘤样品的公认医学程序的例子包括内窥镜检查术、切除活组织检查、切口活组织检查、显微操作针活组织检查、冲钻活组织检查、切割活组织检查和皮肤活组织检查。生物样品应当具有、提供足够rna或提供切片用于测量基因表达的大小。在一些实施方案中,本申请的方法包括在被诊断为患有癌症的人受试者中评价在mrna水平的基因表达的步骤,所述人受试者给出同意书以提供自体组织样品或收集自体组织样品。生物样品可以是允许测量基因表达或其量的任何形式。换而言之,样品必须足够用于rna提取或薄层制备。因此,样品可以是新鲜的,使用合适的低温技术保存,或使用非低温技术保存。例如,操作临床活组织检查样品的标准过程包括将组织样品在福尔马林中固定化并将它埋入石蜡中。这种形式的样品通常被称作福尔马林固定的石蜡包埋的(ffpe)组织。为了随后分析进行组织制备的合适技术是本领域技术人员众所周知的。基因表达在本申请中,使用适当的方法进行在所述生物样品中基因表达水平的确定或测量。一些这样的方法是本领域众所周知的。例如,通过测量样品中rna(例如,mrna)的水平或量,进行基因表达的确定。基于mrna的3末端设计pcr或微阵列中使用的引物和/或探针。这是因为,据信它在rna分离或cdna合成的实验过程中导致高保守性(稳定性)。可以基于希望的序列来设计探针以检测特定形式的转录变体。下面显示了适当的检测方法的例子,但是检测方法不限于此。rna分析用于确定在mrna水平的基因表达水平的方法的例子包括已知的微阵列分析和定量聚合酶链式反应(pcr)。在一些实施方案中,使用标准方案从细胞、肿瘤或组织提取rna。在其它实施方案中,使用不需要rna分离的技术进行rna分析。从组织样品快速地且有效地提取真核mrna(即,聚腺苷酸rna)的方法是充分确立的和本领域技术人员已知的。参见,例如,ausubel等人,1997,currentprotocolsofmolecularbiology,johnwiley&sons。组织样品可以是新鲜的、冷冻的、或固定的和石蜡包埋的(ffpe)临床研究肿瘤样本。通常,从新鲜的或冷冻的组织样品分离的rna倾向于比来自ffpe样品的rna更少片段化。但是,肿瘤材料的ffpe样品是更容易得到的,且ffpe样品是用于用在本发明的方法中的rna的适当来源。关于用于通过rt-pcr进行基因表达概述分析的作为rna来源的ffpe样品的讨论,参见,例如,clark-langone等人,2007,bmcgenomics8:279。也参见deandreus等人,1995,biotechniques18:42044;和baker等人,美国专利申请公开号2005/0095634。通常使用商购可得的试剂盒,其伴有卖方关于rna提取和制备的说明书。各种rna分离产品和完整试剂盒的商业卖方的例子包括qiagen(valencia,ca)、invitrogen(carlsbad,ca)、ambion(austin,tx)和exiqon(woburn,ma)。通常,rna分离开始于组织/细胞破坏。合乎需要的是,在组织/细胞破坏过程中使rna酶的rna降解最小化。在rna分离过程中限制rna酶活性的一个方案是,确保一旦上述细胞被破坏就保持变性剂与细胞内容物接触。另一种常见实践是在rna分离过程中包括一种或多种蛋白酶。如果必要的话,一旦收集就将新鲜组织样品浸渍在室温的rna稳定溶液中。稳定溶液迅速地渗透进细胞并稳定rna用于在4℃保存和随后分离。一种这样的稳定溶液作为rnalater(r)(ambion,austin,tx)可商购得到。在一些方案中,通过氯化绝密度梯度离心从破坏的肿瘤材料分离总rna。通常,mrna占全部细胞rna的约1%至5%。固定化的寡(dt)(例如,寡(dt)纤维素)常用于从核糖体rna和转移rna分离mrna。当在分离后保存时,必须将rna保存在无rna酶条件下。分离的rna的稳定保存的方法是本领域已知的。用于rna的稳定保存的多种市售产品是可得到的。微阵列使用常规的dna微阵列表达概述分析技术可以确定(例如,测量)mrna的表达水平。dna微阵列是固定化在固体表面或支撑层(例如,玻璃、塑料或硅)上的特异性dna区段或探针的集合,其中每种特异性dna区段占据阵列中的已知位置。通常,在严谨条件下与标记的rna的样品的杂交允许检测和定量与上述阵列中的每种探针对应的rna分子。严谨洗涤以除去非特异性地结合的样品材料以后,通过共焦激光显微术或其它合适的检测方法扫描微阵列。当前商购可得的dna微阵列(经常被称作dna芯片)通常含有数万个探针且因而可以同时测量数万个基因的表达。这样的微阵列可以用在本发明的实践中。可替换地,定制(bespoke)芯片可以用在本申请的方法的实践中,所述定制(bespoke)芯片包括许多测量特定基因的表达所需的探针和需要的对照或标准品(例如,用于数据归一化)。双色微阵列读数器可以用于促进数据归一化。在双色(双通道)系统中,用在第一波长发光的第一荧光团标记样品,而用在不同波长发光的第二荧光团标记rna或cdna标准品。例如,cy3(570nm)和cy5(670nm)经常一起用在双色微阵列系统中。dna微阵列技术是充分开发的,商购可得的,并广泛使用的。因而,在实践本申请的方法时,本领域技术人员无需过多实验即可使用微阵列技术来测量编码生物标志物蛋白的基因的表达水平。dna微阵列芯片、试剂(例如,rna或cdna制备、rna或cdna标记所必需的,杂交溶液和清洁溶液)、设备(例如,微阵列读数器)和方案是本领域众所周知的,且可商购得自多种商业来源。微阵列系统的商业卖方的例子包括agilenttechnologies,inc.(santaclara,ca)和affymetrix(santaclara,ca),但是还可以使用来自其它卖方的阵列系统。定量pcr使用常规定量逆转录酶聚合酶链式反应(qrt-pcr)技术可以测量mrna的水平。qrt-pcr的优点包括灵敏度、灵活性、定量准确度和在具有高序列同一性的mrna之间区分的能力。关于为定量pcr处理组织样品的指南可得自多种来源(例如,用于qrt-pcr的设备和试剂的生产商和卖方,诸如qiagen(valencia,ca)和ambion(austin,tx))。用于qrt-pcr的自动操作的设备和系统是商购可得的,且常用在许多实验室中。众所周知的市售系统的例子包括appliedbiosystems7900htfastreal-timepcrsystems(appliedbiosystems,fostercity,ca)。一旦得到分离的mrna,通过rt-pcr进行基因表达测量的第一步是将mrna模板逆转录成cdna。然后在pcr反应中指数扩增cdna。两种常用的逆转录酶是禽类成髓细胞白血病病毒逆转录酶(amv-rt)和莫洛尼鼠白血病病毒逆转录酶(mmlv-rt)。逆转录反应通常用特异性引物、随机六聚体或寡(dt)引物引发。合适的引物是商购可得的(例如,geneamp(r)rnapcr试剂盒(perkinelmerinc.,waltham,ma))。得到的cdna产物可以在随后的聚合酶链式反应中用作模板。使用热稳定的dna依赖性的dna聚合酶进行以上pcr步骤。在pcr系统中最常用的聚合酶是水生栖热菌(taq)聚合酶。pcr的选择性源自与被靶向扩增的dna区域(即,从编码希望的蛋白的基因逆转录的cdna区域)互补的引物的应用。因而,当在本发明中使用qrt-pcr时,对每种标志物基因特异性的引物是基于上述基因的cdna序列。根据卖方的说明书可以使用商业技术(例如,sybr(r)green或taqman(r)(appliedbiosystems,fostercity,ca))。可以如下关于样品之间的负载差异将mrna水平归一化:将所述水平与持家基因(例如,β-肌动蛋白或gapdh)的水平进行对比。可以相对于任何单一对照样品(例如,从正常非肿瘤组织或细胞衍生出的mrna)来表示mrna表达水平。可替换地,可以相对于从肿瘤样品库、肿瘤细胞系衍生出的mrna或商购可得的对照mrna的集合来表示它。本领域技术人员无需过多实验即可设计和合成用于基因表达水平的pcr分析的合适引物集合。可替换地,用于进行本发明的pcr引物集合可以购自商业来源(例如,appliedbiosystems)。pcr引物优选地是约17-25个核苷酸长度的引物。使用解链温度(tm)估计的常规算法,可以将引物设计成具有特定tm。用于引物设计和tm估计的App是商购可得的(例如,primerexpress(tm)(appliedbiosystems)),并且也可在因特网上得到(例如,primer3(massachusettsinstituteoftechnology))。通过应用确立的pcr引物设计原理,许多不同的引物可以用于测量任何给定基因的表达水平。qnpa在一些实施方案中,使用不包括rna提取或分离的技术进行rna分析。一种这样的技术是在名称qnpa(r)下商购可得的定量核酸酶保护测定(highthroughputgenomics,inc.,tucson,az)。当要分析的组织样品呈ffpe材料的形式时,该技术可以是有利的。参见,例如,roberts等人,2007,laboratoryinvestigation87:979-997。ncounter分析系统ncounter(r)是由nanostringtechnologies,inc.开发的基于数字分子条形码技术直接计数分子的系统,并且使得能够在单个试管中快速地和准确地分析多达800种类型的rna和dna。在ncounter的分析中,使具有对靶分子的序列特异性的条形码的探针(报告探针)和用于固定化在分析筒中的探针(捕获探针)与靶核酸杂交,且用荧光扫描仪计数固定化在筒表面上的每个靶序列的颜色条形码的排列。参见,例如,geissg,等人,26:317-25(2008).,naturebiotechnology。htgedgeseq测定edgeseq是由htgmoleculardiagnostics,inc.开发的用于样品概述分析(包括肿瘤概述分析、分子诊断测试和生物标志物的开发)的应用,其由测量仪器、消耗品和App分析组成。通过将核酸酶-保护的化学物质应用于生物样品,使基因和遗传活性的分子概述分析自动化。参见,例如,martelr.,等人.assaydrugdevtechnol.2002nov;1(1):61-71。通过上述得到各个基因的表达量作为计数值。在已经进行校正样品之间的分布变化的归一化方法之后,计数值被用于分析。具体的归一化方法的例子包括中位归一化方法。在中位归一化方法中,通过下面显示的方法为每个样品确定换算系数,并通过将基因的表达量除以换算系数来做出校正。样品i的基因g的换算系数(sig)是通过如下为第i个样品(样品i)的第g个基因(基因g)得到的数目:确定所有样品的表达量(计数值)的几何平均值,并将基因g的表达量除以该几何平均值。为所有基因确定换算系数后,将样品i的中位sig取作样品i的换算系数(si)。最后,将样品i的所有基因的表达量除以si以得到一个值作为中位归一化计数(mnc)。关于该技术的细节,参见,例如,andres,s.和huberwgenomebiol.2010;11(10):r106。下一代rna测序不同于常规的sanger方法,下一代rna测序是采用下一代测序技术的rna测序分析,其能够通过进行先进的并行处理在短时间内和以低成本得到大量序列信息。下一代rna测序可以以更高灵敏度和准确度分析整个转录组的表达。目前使用的典型下一代测序技术的例子包括illuminainc.的边合成边测序(sequencingbysynthesis)和thermofisherscientificinc.的iontorrent技术。关于每种技术的细节,参见,例如,buermanshp.,等人.biochimbiophysacta.2014年10月;1842(10):1932-1941。使用上述下一代测序技术得到的单个序列信息(读出)也用于作图工作(其鉴定从哪种基因转录物衍生出每个读出)和归一化程序(其用转录物的长度、在分析中得到的读出的总数等校正映射至每种转录物的读出的数目)以后的分析。归一化程序的具体例子包括读出/千碱基的外显子/百万映射序列读出(rpkm)值,它是当将转录物的长度设定为1kb且将读出的总数设定为100万时每个基因的基因长度所校正的读出的数目。通常使用的其它例子包括片段/千碱基的外显子/百万映射序列读出(fpkm)值,它是当将读出的总数设定为100万时每个基因的基因长度所校正的读出的数目;和每百万转录物(tpm)值,它是当每种转录物的读出的数目被基因长度校正且将读出的总数设定为100万时的转录物数目。通过使用已知的遗传模型计数映射至外显子的读出来计算每个基因的表达量而得到rpkm,而通过经由计数每个估计的同种型的片段在同种型水平计算表达量而得到fpkm。关于每种归一化的技术的细节,参见,例如,conesaa.,等人.genomebiol.2016年1月26日;17:13。htrop2基因表达的评价可以在来自人患者的生物样品中评价htrop2基因表达。这样的实施方案包括请求在mrna水平的htrop2基因表达的评价和接收评价的结果。一些实施方案包括确定在mrna水平的htrop2基因表达的数值和通过任意方法记录所确定的数值。可以与预定的数值关联地说明htrop2基因的表达水平。当htrop2基因的表达水平等于、大于或等于、或超过预定的数值时,将htrop2基因的表达水平说明为能够预测受试者对用含有抗-htrop2抗体的药物的治疗是敏感的(有应答的)。在一些实施方案中,当htrop2基因的表达水平等于、小于或等于、或低于预定的数值时,将htrop2基因的表达水平说明为能够预测肿瘤对用含有抗-htrop2抗体的药物的治疗是抗性的(非应答的)。在一些实施方案中,基于代表生物样品中htrop2基因的表达水平的数值,可以将htrop2基因表达评价为高或低。基于例如在mrna水平的htrop2表达,可以将受试者评价为具有高或低表达。通过上述的任意已知方法可以评价表达水平。例如,基于通过下一代rna测序计算出的读出/千碱基的外显子/百万映射序列读出(rpkm)值,可以评价htrop2基因表达量。rpkm值是通过使用每个基因的外显子长度和用测序仪读出的序列总数将用下一代测序仪得到的读出数目归一化而得到的值。通过使用log2[rpkm+1]值可以分析htrop2基因的表达量,所述log2[rpkm+1]值是通过向rpkm值加1并将总和转化成对数(log2)而得到的值。rpkm值与htrop2基因表达相关。因而,rpkm值越高,htrop2基因表达越高。在一些实施方案中,当log2[rpkm+1]值大于或等于、或超过预定的数值时,将htrop2基因表达评价为高。预定的数值可以在统计上指定以使不希翼的假阳性和假阴性效应最小化。指定的数值可以选自6.0-9.0的范围。例如,指定的数值可以选自6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8.0、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9和9.0。指定的数值还可以选自6.0-8.0的范围。例如,指定的数值可以选自6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9和8.0。指定的数值可以进一步选自6.5-8.0的范围。例如,指定的数值可以选自6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9和8.0。指定的数值还可以进一步选自7.0-8.0的范围。例如,指定的数值可以选自7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9和8.0。指定的数值还可以进一步选自7.5-8.0的范围。例如,指定的数值可以选自7.5、7.6、7.7、7.8、7.9和8.0。指定的数值还可以选自6.5、7.0、7.5和8.0。基于通过下一代rna测序计算出的片段/千碱基的外显子/百万映射序列读出(fpkm)值,可以评价htrop2基因表达量。fpkm值是通过使用每个基因的基因长度和用测序仪读出的序列总数将用下一代测序仪得到的读出数目归一化而得到的值。通过使用log2[fpkm+1]值可以分析htrop2基因的表达量,所述log2[fpkm+1]值是通过向fpkm值加1并将总和转化成对数(log2)而得到的值。fpkm值与htrop2基因表达相关。因而,fpkm值越高,htrop2基因表达越高。在一些实施方案中,当log2[fpkm+1]值大于或等于、或超过预定的数值时,将htrop2基因表达评价为高。预定的数值可以在统计上指定以使不希翼的假阳性和假阴性效应最小化。指定的数值可以选自6.0-8.0的范围。例如,指定的数值可以选自6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9和8.0。指定的数值还可以选自6.0-7.0的范围。例如,指定的数值可以选自6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9和7.0。指定的数值还可以选作6.0或7.0。基于通过edgeseq测定计算出的中位归一化计数(mnc)值可以评价htrop2基因表达量。mnc值是在edgeseq测定中通过中位归一化方法得到的值。通过使用log2[mnc+1]值可以分析htrop2基因的表达量,所述log2[mnc+1]值是通过向mnc值加1并将总和转化成对数(log2)而得到的值。mnc值与htrop2基因表达相关。因而,mnc值越高,htrop2基因表达越高。在一些实施方案中,当log2[mnc+1]值大于或等于、或超过预定的数值时,将htrop2基因表达评价为高。预定的数值可以在统计上指定以使不希翼的假阳性和假阴性效应最小化。指定的数值可以选自12.0-15.0的范围。例如,指定的数值可以选自12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0.13.1、13.2、13.3、13.4、13.5、13.6、13.7、13.8、13.9、14.0、14.1、14.2、14.3、14.4、14.5、14.6、14.7、14.8、14.9和15.0。指定的数值还可以选自12.0-14.0的范围。例如,指定的数值可以选自12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0.13.1、13.2、13.3、13.4、13.5、13.6、13.7、13.8、13.9和14.0。指定的数值还可以选作12.0、13.0或14.0。在一些实施方案中,使用被管应当局批准的测试方法评价在mrna水平的htrop2基因表达。在一些实施方案中,所述被管应当局批准的测试方法是被fda、ema或pmda批准的测试方法。slfn11基因表达的评价可以在来自人患者的生物样品中评价slfn11基因表达。这样的实施方案包括请求在mrna水平的slfn11基因表达的评价和接收评价的结果。一些实施方案包括确定在mrna水平的slfn11基因表达的数值和通过任意方法记录所确定的数值。可以与预定的数值关联地说明slfn11基因的表达水平。当slfn11基因的表达水平等于、大于或等于、或超过预定的数值时,将slfn11基因的表达水平说明为能够预测受试者对用含有抗-htrop2抗体的药物的治疗是敏感的(有应答的)。在一些实施方案中,当slfn11基因的表达水平等于、小于或等于、或低于预定的数值时,将slfn11基因的表达水平说明为能够预测肿瘤对用含有抗-htrop2抗体的药物的治疗是抗性的(非应答的)。在一些实施方案中,基于代表生物样品中slfn11基因的表达水平的数值,可以将slfn11基因表达评价为高或低。基于例如在mrna水平的slfn11表达,可以将受试者评价为具有高或低表达。通过上述的任意已知方法可以评价表达水平。例如,以与htrop2基因相同的方式基于rpkm值可以评价slfn11基因的表达量。通过使用log2[rpkm+1]值可以分析slfn11基因的表达量,所述log2[rpkm+1]值是通过向rpkm值加1并将总和转化成对数(log2)而得到的值。rpkm值与slfn11基因表达相关。因而,rpkm值越高,slfn11基因表达越高。在一些实施方案中,当log2[rpkm+1]值超过预定的数值时,将slfn11基因表达评价为高。预定的数值可以在统计上指定以使不希翼的假阳性和假阴性效应最小化。指定的数值可以选自1.0-4.0的范围。例如,指定的数值可以选自1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9和4.0。指定的数值还可以选自1.0-3.0的范围。例如,指定的数值可以选自1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9和3.0。指定的数值可以进一步选自2.0-3.0的范围。例如,指定的数值可以选自2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9和3.0。指定的数值可以选自1.0、2.0和3.0,且也可以指定为3.0。以与htrop2基因相同的方式基于fpkm值可以评价slfn11基因的表达量。通过使用log2[fpkm+1]值可以分析slfn11基因的表达量,所述log2[fpkm+1]值是通过向fpkm值加1并将总和转化成对数(log2)而得到的值。fpkm值与slfn11基因表达相关。因而,fpkm值越高,slfn11基因表达越高。在一些实施方案中,当log2[fpkm]值超过预定的数值时,将slfn11基因表达评价为高。预定的数值可以在统计上指定以使不希翼的假阳性和假阴性效应最小化。指定的数值可以选自2.0-4.0的范围。例如,指定的数值可以选自2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9和4.0。指定的数值还可以选自2.0-3.0的范围。例如,指定的数值可以选自2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9和3.0。指定的数值可以选择为2.0或3.0。以与htrop2基因相同的方式基于mnc值可以评价slfn11基因的表达量。使用log2[mnc+1]值可以分析slfn11基因的表达量,所述log2[mnc+1]值是通过向mnc值加1并将总和转化成对数(log2)而得到的值。mnc值与slfn11基因表达相关。因而,mnc值越高,slfn11基因表达越高。在某些实施方案中,当log2[mnc]值超过预定的数值时,将slfn11基因表达评价为高。预定的数值可以在统计上指定以使不希翼的假阳性和假阴性效应最小化。指定的数值可以选自11.5-13.5的范围。例如,指定的数值可以选自11.5、11.6、11.7、11.8、11.9、12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0、13.1、13.2、13.3、13.4和13.5。指定的数值还可以选自11.5-12.5的范围。例如,指定的数值可以选自11.5、11.6、11.7、11.8、11.9、12.0、12.1、12.2、12.3、12.4和12.5。指定的数值可以选择为11.5、12.0或12.5。在一些实施方案中,使用被管应当局批准的测试方法评价在mrna水平的slfn11基因表达。在一些实施方案中,所述被管应当局批准的测试方法是被fda、ema或pmda批准的测试方法。施用和治疗在一些实施方案中,与slfn11基因表达组合地可以评价htrop2基因表达的评价。两种敏感性标志物的组合会实现更准确的评价。在一些实施方案中,当已经将htrop2基因和/或slfn11基因的表达评价为高时,可以给患有癌症的人患者给予含有抗-htrop2抗体的药物并用其治疗。在一些实施方案中,当已经将htrop2基因和/或slfn11基因的表达评价为低时,可以避免向患有癌症的人患者施用含有抗-htrop2抗体的药物。含有抗-htrop2抗体的药物的优选剂量的例子包括、但不限于2.0mg/kg、4.0mg/kg、6.0mg/kg、8.0mg/kg或10.0mg/kg。并且,含有抗-htrop2抗体的药物的优选给药间隔的例子包括、但不限于3-周间隔。基于rpkm值可以评价htrop2和slfn11基因的表达量。通过使用log2[rpkm+1]值可以分析每个基因的表达量,所述log2[rpkm+1]值是通过向rpkm值加1并将总和转化成对数(log2)而得到的值。预定的数值可以在统计上指定以使不希翼的假阳性和假阴性效应最小化。如上所述,htrop2基因的log2[rpkm+1]值可以指定在6.0-9.0的范围内。slfn11基因的log2[rpkm+1]值也可以指定在1.0-4.0的范围内。当使用指定的数值的组合时,当htrop2和slfn11基因两者都满足指定的值时,可以给患有癌症的人患者给予含有抗-htrop2抗体的药物并用其治疗。在一些实施方案中,当htrop2和slfn11基因中的任一个满足指定的值时,可以给患有癌症的人患者给予含有抗-htrop2抗体的药物并用其治疗。htrop2和slfn11基因的指定log2[rpkm+1]值的优选组合的例子包括:htrop2基因的选自7.5、7.6、7.7、7.8、7.9和8.0的一个值与slfn11基因的选自1.0、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9和2.0的一个值的组合;htrop2基因的选自6.5、6.6、6.7、6.8、6.9和7.0的一个值与slfn11基因的选自2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9和3.0的一个值的组合;和htrop2基因的选自7.0、7.1、7.2、7.3、7.4和7.5的一个值与slfn11基因的选自2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9和3.0的一个值的组合。htrop2基因和slfn11基因的指定log2[rpkm+1]值的优选组合的其它例子包括:htrop2基因的选自7.5、7.6、7.7、7.8、7.9和8.0的一个值与slfn11基因的选自2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9和3.0的一个值的组合;htrop2基因的选自6.5、6.6、6.7、6.8、6.9和7.0的一个值与slfn11基因的选自3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9和4.0的一个值的组合;htrop2基因的选自7.0、7.1、7.2、7.3、7.4和7.5的一个值与slfn11基因的选自3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9和4.0的一个值的组合;和htrop2基因的选自7.5、7.6、7.7、7.8、7.9和8.0的一个值与slfn11基因的选自3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9和4.0的一个值的组合。htrop2基因和slfn11基因的指定log2[rpkm+1]值的进一步优选组合的例子包括这样的情况:其中满足htrop2基因的7.5和slfn11基因的1.0的组合或者htrop2基因的6.5和slfn11基因的2.0的组合中的任一个。htrop2基因和slfn11基因的指定log2[rpkm+1]值的进一步优选组合的其它例子包括这样的情况:其中满足htrop2基因的7.5和slfn11基因的2.0的组合或者htrop2基因的6.5和slfn11基因的3.0的组合中的任一个。htrop2基因和slfn11基因的指定log2[rpkm+1]值的进一步优选组合的其它例子包括选自以下的任一个组合:htrop2基因的7.5和slfn11基因的1.0的组合,htrop2基因的6.5和slfn11基因的2.0的组合,htrop2基因的7.5和slfn11基因的2.0的组合,以及htrop2基因的6.5和slfn11基因的3.0的组合。基于fpkm值也可以评价htrop2和slfn11基因的表达量。通过使用log2[fpkm+1]值可以分析每个基因的表达量,所述log2[fpkm+1]值是通过向fpkm值加1并将总和转化成对数(log2)而得到的值。预定的数值可以在统计上指定以使不希翼的假阳性和假阴性效应最小化。如上所述,htrop2基因的log2[fpkm+1]值可以指定在6.0-8.0的范围内。slfn11基因的log2[fpkm+1]值也可以指定在2.0-4.0的范围内。当使用指定的数值的组合时,当htrop2和slfn11基因两者都满足指定的值时,可以给患有癌症的人患者给予含有抗-htrop2抗体的药物并用其治疗。在一些实施方案中,当htrop2和slfn11基因中的任一个满足指定值时,可以给患有癌症的人患者给予含有抗-htrop2抗体的药物并用其治疗。htrop2和slfn11基因的指定log2[fpkm+1]值的优选组合的例子包括htrop2基因的选自7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9和8.0的一个值与slfn11基因的选自2.0、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9和3.0的一个值的组合。优选组合的其它例子包括htrop2基因的选自6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9和7.0的一个值与slfn11基因的选自3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9和4.0的一个值的组合。优选组合的其它例子包括htrop2基因的选自7.0、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9和8.0的一个值与slfn11基因的选自3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9和4.0的一个值的组合。htrop2基因和slfn11基因的指定log2[fpkm+1]值的进一步优选组合的其它例子包括选自以下的任一个组合:htrop2基因的7.0和slfn11基因的2.0的组合,htrop2基因的6.0和slfn11基因的3.0的组合,以及htrop2基因的7.0和slfn11基因的3.0的组合。基于mnc值可以进一步评价htrop2和slfn11基因的表达量。通过使用log2[mnc+1]值可以分析每个基因的表达量,所述log2[mnc+1]值是通过向mnc值加1并将总和转化成对数(log2)而得到的值。预定的数值可以在统计上指定以使不希翼的假阳性和假阴性效应最小化。如上所述,htrop2基因的log2[mnc+1]值可以指定在12.0-14.0的范围内。slfn11基因的log2[mnc+1]值也可以指定在11.5-12.5的范围内。当使用指定的数值的组合时,当htrop2和slfn11基因两者都满足指定的值时,可以给患有癌症的人患者给予含有抗-htrop2抗体的药物并用其治疗。在一些实施方案中,当htrop2和slfn11基因中的任一个满足指定值时,可以给患有癌症的人患者给予含有抗-htrop2抗体的药物并用其治疗。htrop2和slfn11基因的指定log2[mnc+1]值的优选组合的例子包括htrop2基因的选自12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0.13.1、13.2、13.3、13.4、13.5、13.6、13.7、13.8、13.9、14.0、14.1、14.2、14.3、14.4、14.5、14.6、14.7、14.8、14.9和15.0的一个值与slfn11基因的选自11.5、11.6、11.7、11.8、11.9、12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0、13.1、13.2、13.3、13.4和13.5的一个值的组合。优选组合的其它例子包括htrop2基因的选自12.0、12.1、12.2、12.3、12.4、12.5、12.6、12.7、12.8、12.9、13.0.13.1、13.2、13.3、13.4、13.5、13.6、13.7、13.8、13.9和14.0的一个值与slfn11基因的选自11.5、11.6、11.7、11.8、11.9、12.0、12.1、12.2、12.3、12.4和12.5的一个值的组合。所述组合的其它例子包括htrop2基因的选自12.0、13.0或14.0的一个值与slfn11基因的选自11.5、12.0或12.5的一个值的组合。htrop2基因和slfn11基因的指定log2[mnc+1]值的进一步优选组合的其它例子包括选自以下的任一个组合:htrop2基因的12.0和slfn11基因的11.5的组合,htrop2基因的14.0和slfn11基因的11.5的组合,htrop2基因的12.0和slfn11基因的12.5的组合,以及htrop2基因的14.0和slfn11基因的12.5的组合。对于htrop2基因和slfn11基因可以同时进行基因表达的测量和评价。可替换地,可以首先进行对htrop2基因表达量的测量和评价,且然后对于已经将其htrop2基因的表达量评价为高的人患者,可以进行对slfn11基因表达量的测量和评价。可替换地,可以首先进行对slfn11基因表达量的测量和评价,且然后对于已经将其slfn11基因的表达量评价为高的人患者,可以进行对htrop2基因表达量的测量和评价。在一些实施方案中,使用被管应当局批准的测试方法评价在mrna水平的htrop2和slfn11基因表达。在一些实施方案中,所述被管应当局批准的测试方法是被fda、ema或pmda批准的测试方法。测试试剂盒本发明也涉及一种诊断测试试剂盒,其包含用于实现本发明的方法的几种构型。所述诊断测试试剂盒改善进行诊断测定时的便利、迅速和再现性。例如,在基于qrt-pcr的实施方案中,基本诊断测试试剂盒包括分析基因表达的pcr引物。在其它实施方案中,除了pcr引物以外,一种更具体的测试试剂盒还包括缓冲剂、试剂和关于使用pcr技术测量基因表达水平的详细说明书。在一些实施方案中,除了进行测试所必需的rna样品以外,所述试剂盒还包括测试方案和所有消耗品。实施例下述实施例详细描述了本发明,但是本发明不受这些实施例限制。实施例1.抗体-药物缀合物的生产根据在wo2015/098099和wo2017/002776中描述的生产方法,使用人源化的抗-htrop2抗体(包含由seqidno:1的氨基酸残基20-470组成的氨基酸序列所组成的重链和由seqidno:2的氨基酸残基21-234组成的氨基酸序列所组成的轻链的抗体)生产了抗体-药物缀合物(在下文中,所述抗体-药物缀合物是被称作抗体-药物缀合物(1)),其中药物-接头由下式表示:[式7]其中a代表与抗-htrop2抗体的连接位置,且抗-htrop2抗体通过硫醚键彼此缀合。尽管每个抗体分子缀合的药物的平均数目可以在0-8的范围内调节,这次生产了具有3.5-4.5的药物缀合物平均数目的抗体-药物缀合物并用在下述实施例中。实施例2.抗体-药物缀合物(1)的抗肿瘤作用的评价小鼠:在实验应用之前,使5-8周龄的雌性nu/nu小鼠(envigo)在spf条件下适应3天或更久。给小鼠饲喂无菌固体饲料(teklad2919,envigo)并给予反渗透膜处理过的水(含有2ppm氯)。测量和计算公式:每周2次用电子数字测径器(cd-6pmx,mitutoyocorp.)测量肿瘤的长和短直径,并使用下述计算公式计算肿瘤体积(mm3):肿瘤体积(mm3)=0.52x长直径(mm)x[短直径(mm)]2将来自每位癌症患者的肿瘤片段皮下地植入小鼠中并传代。将得到的肿瘤用于作为肿瘤片段(将它们切成大约5x5x5mm3)皮下地植入雌性nu/nu小鼠的左腹部,由此建立每个患者-衍生的异种移植物(pdx)模型。当平均移植的肿瘤体积达到150-300mm3时(第0天),将小鼠随机分组。在分组的同一天,将抗体-药物缀合物(1)以10mg/kg的剂量施用进尾静脉。以10ml/kg的体积与阴性对照类似地施用制剂缓冲液。使用在施用后21天的每个肿瘤体积(表1),根据下述计算公式计算肿瘤生长抑制率(tgi(%))。肿瘤生长抑制率(%)=100×(1-tf/平均cf)tf:在施用抗体-药物缀合物(1)后21天的肿瘤体积平均cf:在阴性对照组小鼠中施用后21天的算术平均肿瘤体积在championsoncology,inc.进行所有以上测试。[表1]抗体-药物缀合物(1)在每个pdx模型中的抗肿瘤活性(tgi%)模型id癌tgi(%)#1乳腺癌98.1#2肺癌77.3#3胆管上皮癌48.0#4胰腺癌48.5#5结肠直肠癌65.0#6乳腺癌95.5#7乳腺癌94.7#8头颈癌55.6#9头颈癌99.1#10肺癌97.7#11肺癌95.4#12乳腺癌95.8#13肺癌70.0#14乳腺癌90.1#15胆管上皮癌61.2#16结肠直肠癌52.7#17乳腺癌62.6#18肺癌18.4#19肺癌50.3实施例3.在从每个pdx小鼠模型衍生出的肿瘤中的htrop2和slfn11基因表达(rpkm值)及其与抗体-药物缀合物(1)的抗肿瘤活性的关系在championsoncology,inc.得到关于实施例2中所用的每个pdx模型中的基因表达量的数据并归一化,由此得到rpkm值。向rpkm值加1,并将总和转化成对数(log2)以得到log2[rpkm+1]值(表2)。使用log2[rpkm+1]值分析抗体-药物缀合物(1)在各pdx模型中的抗肿瘤活性(表1)与htrop2基因和slfn11基因的表达量之间的关系。当评价的所有模型被分组到具有htrop2和slfn11基因的至少某种表达量的组中时(表3),显示随着htrop2基因表达和slfn11基因表达增加,显示出至少某种药物效力(在该情况下,采用75%或更高的tgi的判据作为一个例子)的动物模型的比例更高(表4)。在没有通过slfn11基因表达分组存在下,显示出75%或更高的tgi的动物模型的比例不超过47-63%。因而,揭示了htrop2基因表达量和slfn11基因表达量的组合可以用作敏感性标志物来预测抗体-药物缀合物(1)的抗肿瘤作用。例如,当htrop2基因的log2[rpkm+1]值超过7.5且slfn11基因的log2[rpkm+1]值超过1.0时,或当htrop2基因的log2[rpkm+1]值超过6.5且slfn11基因的log2[rpkm+1]超过2.0时,显示出75%或更高的tgi的动物模型的比例为约80%至100%。此外,当htrop2基因的log2[rpkm+1]值超过7.5且slfn11基因的log2[rpkm+1]值超过2.0时,或当htrop2基因的log2[rpkm+1]值超过6.5且slfn11基因的log2[rpkm+1]超过3.0时,显示出75%或更高的tgi的动物模型的比例为100%。应当指出,甚至当tgi为60%或更高或70%或更高时,也可能使用当tgi为75%或更高时指定的每个log2[rpkm+1]值以相当的预测率预测抗肿瘤作用。当tgi为80%或更高时,仅当htrop2基因的log2[rpkm+1]值超过7.5且slfn11基因的log2[rpkm+1]值超过1.0且小于或等于2时,预测率下降至60%量级。[表2]在每个pdx模型中的htrop2基因和slfn11基因表达模型idhtrop2基因表达量(log2[rpkm+1])slfn11基因表达量(log2[rpkm+1])#17.053.41#28.371.59#38.090.16#48.250.40#56.720.09#66.990.00#75.270.67#88.731.66#98.134.15#108.253.42#116.284.05#127.682.31#134.895.00#148.392.03#156.690.01#166.801.09#176.102.78#187.291.74#197.102.83[表3]具有htrop2基因和slfn11基因的至少某种表达量的pdx模型的数目[表4]在具有htrop2基因和slfn11基因的至少某种表达量的pdx模型中通过抗体-药物缀合物(1)显示出75%或更高的tgi的pdx模型的比例实施例4.抗体-药物缀合物(2)的抗肿瘤作用的评价小鼠:在实验应用之前,使5-8周龄的雌性nu/nu小鼠(envigo)在spf条件下适应3天或更久。给小鼠饲喂无菌固体饲料(teklad2919,envigo)并给予反渗透膜处理过的水(含有2ppm氯)。测量和计算公式:每周2次用电子数字测径器(cd-6pmx,mitutoyocorp.)测量肿瘤的长和短直径,并使用下述计算公式计算肿瘤体积(mm3):肿瘤体积(mm3)=0.52x长直径(mm)x[短直径(mm)]2将来自每个癌症患者的肿瘤片段皮下地植入小鼠中并传代。将得到的肿瘤用于皮下植入肿瘤片段,将其切成约5x5x5mm3,植入雌性nu/nu小鼠的左腹,由此建立每个患者-衍生异种移植物(pdx)模型。当平均移植的肿瘤体积达到150-300mm3时(第0天),将小鼠随机分组。在分组的同一天,将抗体-药物缀合物(1)以10mg/kg的剂量施用进尾静脉。以10ml/kg的体积与阴性对照类似地施用制剂缓冲液。对于在实施例2和本实施例中评价的pdx模型,使用在施用后10-15天的每个肿瘤体积(表5),根据下述计算公式计算肿瘤生长抑制率(tgi(%))。肿瘤生长抑制率(%)=100×(1-tf/平均cf)tf:在施用抗体-药物缀合物(1)后10-15天的肿瘤体积平均cf:在阴性对照组小鼠中施用后10-15天的算术平均肿瘤体积[表5]抗体-药物缀合物(1)在每个pdx模型中的抗肿瘤活性(tgi%)模型id癌症种类tgi(%)评价时间点#1乳腺癌95.2第14天#2肺癌68.3第14天#3胆管上皮癌22.2第14天#4胰腺癌21.8第14天#5结肠直肠癌41.7第14天#6乳腺癌92.4第14天#7乳腺癌87.6第15天#8头颈癌57.9第14天#9头颈癌94.0第14天#10肺癌97.3第14天#11肺癌87.4第14天#12乳腺癌90.0第15天#13肺癌62.3第14天#14乳腺癌82.7第14天#15胆管上皮癌46.4第14天#16结肠直肠癌26.0第14天#17乳腺癌56.5第14天#18肺癌14.6第14天#19肺癌28.1第14天#20肺癌82.0第14天#21肺癌76.6第14天#22肺癌87.9第14天#23肺癌4.7第14天#24肺癌19.1第14天#25胰腺癌37.9第14天#26胰腺癌62.3第13天#27肺癌48.5第13天#28乳腺癌92.6第14天#29乳腺癌97.4第14天#30肺癌84.7第10天#31结肠直肠癌58.4第14天#32肺癌64.9第13天#33肺癌25.0第14天#34肺癌89.7第13天#35肺癌-0.4第14天实施例5.在从每个pdx小鼠模型衍生出的肿瘤中的htrop2和slfn11基因表达(fpkm值)及其与抗体-药物缀合物(1)的抗肿瘤活性的关系使用从每个肿瘤的福尔马林固定的石蜡包埋的样本提取的rna,通过下一代rna测序方法得到关于实施例4中所用的每个pdx模型中的基因表达量的数据。将得到的数据针对fpkm值归一化以后,向fpkm值加1,并将总和转化成对数(log2)以得到log2[fpkm+1]值(表6)。使用log2[fpkm+1]值分析抗体-药物缀合物(1)在各pdx模型中的抗肿瘤活性(表5)与htrop2基因和slfn11基因的表达量之间的关系。当评价的所有模型被分组到具有htrop2和slfn11基因的至少某种表达量的组中时(表7),显示随着htrop2基因表达和slfn11基因表达增加,显示出至少某种药物效力(在该情况下,采用75%或更高的tgi的判据作为一个例子)的动物模型的比例更高(表8)。在没有通过slfn11基因表达分组存在下,显示出75%或更高的tgi的动物模型的比例不超过43-50%。因而,揭示了htrop2基因表达量和slfn11基因表达量的组合可以用作敏感性标志物来预测抗体-药物缀合物(1)的抗肿瘤作用。例如,当htrop2基因的log2[fpkm+1]值超过7.0且slfn11基因的log2[fpkm+1]值超过2.0时,或当htrop2基因的log2[fpkm+1]值超过6.0且slfn11基因的log2[fpkm+1]超过3.0时,其中tgi指示75%或更高的动物模型的比例为约80%至100%。此外,当htrop2基因的log2[fpkm+1]值超过7.0且slfn11基因的log2[fpkm+1]值超过3.0时,显示出75%或更高的tgi的动物模型的比例为100%。应当指出,甚至当tgi为70%或更高或80%或更高时,也可能使用当tgi为75%或更高时指定的每个log2[fpkm+1]值以相当的预测率预测抗肿瘤作用。[表6]在每个pdx模型中的htrop2基因和slfn11基因表达模型idhtrop2基因表达量(log2[fpkm+1])slfn11基因表达量(log2[fpkm+1])#17.561.25#28.002.39#37.151.71#47.400.59#56.790.13#66.300.15#74.671.82#86.522.99#96.755.06#107.572.99#117.324.20#127.112.69#133.855.02#147.733.11#157.020.00#167.081.06#176.092.70#187.701.06#195.573.40#206.831.28#217.690.64#227.694.17#237.100.05#246.670.00#256.544.07#265.890.00#275.480.08#286.382.28#297.973.56#301.644.23#315.710.00#324.843.87#332.785.30#344.995.40#357.020.01[表7]具有htrop2基因和slfn11基因的至少某种表达量的pdx模型的数目[表8]在具有htrop2基因和slfn11基因的至少某种表达量的pdx模型中通过抗体-药物缀合物(1)显示出75%或更高的tgi的pdx模型的比例实施例6.化合物(1)的生产根据在wo2014/057687和wo2015/115091中描述的生产方法,生产由下式表示的化合物(在下文中,被称作“化合物(1)”):[式8]。实施例7.在slfn11敲低后的细胞增殖抑制测试7-(1):对人咽癌细胞系fadu的作用从atcc得到人咽癌细胞系fadu并用于评价。将以2×105个细胞/ml悬浮于含有非必需氨基酸溶液、丙酮酸溶液和10%胎牛血清的mem培养基中的fadu细胞以10ml/皿接种在10cm细胞培养皿中。接种后24小时,将100pmol的on-targetplusslfn11sirna(dharmaconinc.)或on-targetplus非靶向对照库(dharmaconinc.)和30μl的lipofectamine(tm)rnaimaxtransfectionreagent(thermofisherscientificinc.)悬浮于1ml的opti-mem培养基中,并将整个量的悬浮液加入培养基。72小时以后,将培养基除去并将培养皿用pbs洗涤,然后将细胞解离并使用1mltryple(tm)express从培养皿回收。将回收的细胞以5×104个细胞/ml悬浮在含有非必需氨基酸溶液、丙酮酸溶液和10%胎牛血清的mem培养基中,并以100μl/孔接种在96-孔细胞培养板中。接种后24小时,将培养基用含有100nm、33nm、11nm、3.7nm、1.2nm、0.41nm、0.13nm、0.045nm或0nm化合物(1)或抗体-药物缀合物(1)的培养基以100μl/孔替换。通过将平均分子量设定至150,000,计算抗体-药物缀合物(1)的摩尔浓度。细胞全部在37℃在5%co2下培养。从培养基替换起72小时后,以100μl/孔加入atplite1步检测系统(perkinelmerinc.)。将孔在室温温育10分钟,然后测量每个孔的发光强度。使用下述计算公式计算在每种条件下的细胞生长抑制率(%):细胞生长抑制率(%)=100×(1-t/c)t:加入样本的每个孔的平均发光强度c:加入0nm样本的每个孔的平均发光强度通过拟合至下述计算公式计算在每种条件下的50%抑制浓度:细胞生存力(%)=(emax-emin)×样本浓度γ/((emax-50)/(50-emin)×ic50γ+样本浓度γ)+eminemax:最大细胞生长抑制率(%)emin:最小细胞生长抑制率(%)ic50:50%抑制浓度γ:希尔系数使用sassystemsrelease9.2(sasinstituteinc.)进行与计算公式的拟合。在slfn11敲低后化合物(1)或抗体-药物缀合物(1)在fadu细胞中的细胞增殖抑制作用显示在图4中。每个计算的50%抑制浓度显示在表9中。在fadu细胞系中的slfn11敲低减弱了化合物(1)和抗体-药物缀合物(1)的细胞增殖抑制作用。[表9]在slfn11敲低后化合物(1)和抗体-药物缀合物(1)在fadu细胞中的细胞增殖50%抑制浓度及其倍数变化7-(2):对人肺癌细胞系nci-h1781的作用从atcc得到人肺癌细胞系nci-h1781并用于评价。将以2×105个细胞/ml悬浮于含有10%胎牛血清的rpmi-1640培养基中的nci-h1781细胞以10ml/皿接种在10cm细胞培养皿中。接种后24小时,将100pmol的on-targetplusslfn11sirna(dharmaconinc.)或on-targetplus非靶向对照库(dharmaconinc.)和30μl的lipofectamine(tm)rnaimaxtransfectionreagent(thermofisherscientificinc.)悬浮于1ml的opti-mem培养基中,并将整个量的悬浮液加入培养基。72小时以后,将培养基除去并将培养皿用pbs洗涤,然后将细胞解离并使用1mltryple(tm)express从培养皿回收。将回收的细胞以5×104个细胞/ml悬浮在含有10%胎牛血清的rpmi-1640培养基中,并以100μl/孔接种在96-孔细胞培养板中。接种后24小时,将培养基用含有100nm、33nm、11nm、3.7nm、1.2nm、0.41nm、0.13nm、0.045nm或0nm化合物(1)或抗体-药物缀合物(1)的培养基以100μl/孔替换。通过将平均分子量设定至150,000,计算抗体-药物缀合物(1)的摩尔浓度。细胞全部在37℃在5%co2下培养。从培养基替换起72小时后,以100μl/孔加入atplite1步检测系统(perkinelmerinc.)。将孔在室温温育10分钟,然后测量每个孔的发光强度。使用下述计算公式计算在每种条件下的细胞生长抑制率(%):细胞生长抑制率(%)=100×(1-t/c)t:加入样本的每个孔的平均发光强度c:加入0nm样本的每个孔的平均发光强度通过拟合至下述计算公式计算在每种条件下的50%抑制浓度:细胞生存力(%)=(emax-emin)×样本浓度γ/((emax-50)/(50-emin)×ic50γ+样本浓度γ)+eminemax:最大细胞生长抑制率(%)emin:最小细胞生长抑制率(%)ic50:50%抑制浓度γ:希尔系数使用sassystemsrelease9.2(sasinstituteinc.)进行与计算公式的拟合。在slfn11敲低后化合物(1)或抗体-药物缀合物(1)在nci-h1781细胞中的细胞增殖抑制作用显示在图5中。每个计算的50%抑制浓度显示在表10中。在nci-h1781细胞系中的slfn11敲低减弱了化合物(1)和抗体-药物缀合物(1)的细胞增殖抑制作用。[表10]在slfn11敲低后化合物(1)和抗体-药物缀合物(1)在nci-h1781细胞中的细胞增殖50%抑制浓度及其倍数变化7-(3):对人肺癌细胞系calu-3的作用从atcc得到人肺癌细胞系calu-3并用于评价。将以2×105个细胞/ml悬浮于含有非必需氨基酸溶液、丙酮酸溶液和10%胎牛血清的mem培养基中的calu-3细胞以10ml/皿接种在10cm细胞培养皿中。接种后24小时,将100pmol的on-targetplusslfn11sirna(dharmaconinc.)或on-targetplus非靶向对照库(dharmaconinc.)和30μl的lipofectamine(tm)rnaimaxtransfectionreagent(thermofisherscientificinc.)悬浮于1ml的opti-mem培养基中,并将整个量的悬浮液加入培养基。72小时以后,将培养基除去并将培养皿用pbs洗涤,然后将细胞解离并使用1mltryple(tm)express从培养皿回收。将回收的细胞以5×104个细胞/ml悬浮在含有非必需氨基酸溶液、丙酮酸溶液和10%胎牛血清的mem培养基中,并以100μl/孔接种在96-孔细胞培养板中。接种后24小时,将培养基用含有100nm、33nm、11nm、3.7nm、1.2nm、0.41nm、0.13nm、0.045nm或0nm化合物(1)或抗体-药物缀合物(1)的培养基以100μl/孔替换。通过将平均分子量设定至150,000,计算抗体-药物缀合物(1)的摩尔浓度。细胞全部在37℃在5%co2下培养。从培养基替换起72小时后,以100μl/孔加入atplite1步检测系统(perkinelmerinc.)。将孔在室温温育10分钟,然后测量每个孔的发光强度。使用下述计算公式计算在每种条件下的细胞生长抑制率(%):细胞生长抑制率(%)=100×(1-t/c)t:加入样本的每个孔的平均发光强度c:加入0nm样本的每个孔的平均发光强度通过拟合至下述计算公式计算在每种条件下的50%抑制浓度:细胞生存力(%)=(emax-emin)×样本浓度γ/((emax-50)/(50-emin)×ic50γ+样本浓度γ)+eminemax:最大细胞生长抑制率(%)emin:最小细胞生长抑制率(%)ic50:50%抑制浓度γ:希尔系数使用sassystemsrelease9.2(sasinstituteinc.)进行与计算公式的拟合。在slfn11敲低后化合物(1)或抗体-药物缀合物(1)在calu-3细胞中的细胞增殖抑制作用显示在图6中。每个计算的50%抑制浓度显示在表11中。在calu-3细胞系中的slfn11敲低减弱了化合物(1)的细胞增殖抑制作用。[表11]在slfn11敲低后化合物(1)和抗体-药物缀合物(1)在calu-3细胞中的细胞增殖50%抑制浓度及其倍数变化7-(4):对人乳腺癌细胞系mda-mb-468的作用从atcc得到人乳腺癌细胞系mda-mb-468并用于评价。将以2×105个细胞/ml悬浮于含有10%胎牛血清的rpmi-1640培养基中的mda-mb-468细胞以10ml/皿接种在10cm细胞培养皿中。接种后24小时,将100pmol的on-targetplusslfn11sirna(dharmaconinc.)或on-targetplus非靶向对照库(dharmaconinc.)和30μl的lipofectamine(tm)rnaimaxtransfectionreagent(thermofisherscientificinc.)悬浮于1ml的opti-mem培养基中,并将整个量的悬浮液加入培养基。72小时以后,将培养基除去并将培养皿用pbs洗涤,然后将细胞解离并使用1mltryple(tm)express从培养皿回收。将回收的细胞以5×104个细胞/ml悬浮在含有10%胎牛血清的rpmi-1640培养基中,并以100μl/孔接种在96-孔细胞培养板中。接种后24小时,将培养基用含有100nm、33nm、11nm、3.7nm、1.2nm、0.41nm、0.13nm、0.045nm或0nm化合物(1)或抗体-药物缀合物(1)的培养基以100μl/孔替换。通过将平均分子量设定至150,000,计算抗体-药物缀合物(1)的摩尔浓度。细胞全部在37℃在5%co2下培养。从培养基替换起72小时后,以100μl/孔加入atplite1步检测系统(perkinelmerinc.)。将孔在室温温育10分钟,然后测量每个孔的发光强度。使用下述计算公式计算在每种条件下的细胞生长抑制率(%):细胞生长抑制率(%)=100×(1-t/c)t:加入样本的每个孔的平均发光强度c:加入0nm样本的每个孔的平均发光强度通过拟合至下述计算公式计算在每种条件下的50%抑制浓度:细胞生存力(%)=(emax-emin)×样本浓度γ/((emax-50)/(50-emin)×ic50γ+样本浓度γ)+eminemax:最大细胞生长抑制率(%)emin:最小细胞生长抑制率(%)ic50:50%抑制浓度γ:希尔系数使用sassystemsrelease9.2(sasinstituteinc.)进行与计算公式的拟合。在slfn11敲低后化合物(1)或抗体-药物缀合物(1)在mda-mb-468细胞中的细胞增殖抑制作用显示在图7中。每个计算的50%抑制浓度显示在表12中。在mda-mb-468细胞系中的slfn11敲低减弱了化合物(1)的细胞增殖抑制作用。[表12]在slfn11敲低后化合物(1)和抗体-药物缀合物(1)在mda-mb-468细胞中的细胞增殖50%抑制浓度及其倍数变化7-(5):对人乳腺癌细胞系hcc38的作用从atcc得到人乳腺癌细胞系hcc38并用于评价。将以2×105个细胞/ml悬浮于含有10%胎牛血清的rpmi-1640培养基中的hcc38细胞以10ml/皿接种在10cm细胞培养皿中。接种后24小时,将100pmol的on-targetplusslfn11sirna(dharmaconinc.)或on-targetplus非靶向对照库(dharmaconinc.)和30μl的lipofectamine(tm)rnaimaxtransfectionreagent(thermofisherscientificinc.)悬浮于1ml的opti-mem培养基中,并将整个量的悬浮液加入培养基。72小时以后,将培养基除去并将培养皿用pbs洗涤,然后将细胞解离并使用1mltryple(tm)express从培养皿回收。将回收的细胞以5×104个细胞/ml悬浮在含有10%胎牛血清的rpmi-1640培养基中,并以100μl/孔接种在96-孔细胞培养板中。接种后24小时,将培养基用含有100nm、33nm、11nm、3.7nm、1.2nm、0.41nm、0.13nm、0.045nm或0nm化合物(1)或抗体-药物缀合物(1)的培养基以100μl/孔替换。通过将平均分子量设定至150,000,计算抗体-药物缀合物(1)的摩尔浓度。细胞全部在37℃在5%co2下培养。从培养基替换起72小时后,以100μl/孔加入atplite1步检测系统(perkinelmerinc.)。将孔在室温温育10分钟,然后测量每个孔的发光强度。使用下述计算公式计算在每种条件下的细胞生长抑制率(%):细胞生长抑制率(%)=100×(1-t/c)t:加入样本的每个孔的平均发光强度c:加入0nm样本的每个孔的平均发光强度通过拟合至下述计算公式计算在每种条件下的50%抑制浓度:细胞生存力(%)=(emax-emin)×样本浓度γ/((emax-50)/(50-emin)×ic50γ+样本浓度γ)+eminemax:最大细胞生长抑制率(%)emin:最小细胞生长抑制率(%)ic50:50%抑制浓度γ:希尔系数使用sassystemsrelease9.2(sasinstituteinc.)进行与计算公式的拟合。在slfn11敲低后化合物(1)或抗体-药物缀合物(1)在hcc38细胞中的细胞增殖抑制作用显示在图8中。每个计算的50%抑制浓度显示在表13中。在hcc38细胞系中的slfn11敲低减弱了化合物(1)和抗体-药物缀合物(1)的细胞增殖抑制作用。[表13]在slfn11敲低后化合物(1)和抗体-药物缀合物(1)在hcc38细胞中的细胞增殖50%抑制浓度及其倍数变化实施例8.在临床试验中从每位患者衍生出的肿瘤的htrop2和slfn11基因表达(中位归一化计数值)以及表达量与抗体-药物缀合物(1)的抗肿瘤活性之间的关系8-(1)研究计划和药物作用在具有复发和晚期非小细胞肺癌的患者的1期研究的剂量递增部分中,每3周1次静脉内地施用抗体-药物缀合物(1),直到观察到病理学状况的不可接受的毒性或恶化。在周期1(第1-21天)中确定剂量限制毒性。在临床研究之后在第一剂量后进行肿瘤取样。在每位患者中施用的剂量和最大肿瘤变化率(%)显示在表14中。应当指出,最大肿瘤变化率的负值是指抗体-药物缀合物(1)的施用已经减小了肿瘤。8-(2)肿瘤中slfn11、trop2mrna水平的测量在抗体-药物缀合物(1)施用之前从每位患者的福尔马林固定的石蜡包埋的肿瘤组织样本制备切片,并通过激光显微切割切出肿瘤部位,然后通过edgeseq得到每位患者的基因表达数据。将得到的计数数据通过中位归一化方法归一化,由此得到每个基因的表达量。在htgmoleculardiagnostics,inc.进行所有以上测试。向在htgmoleculardiagnostics,inc.得到并归一化以后的中位归一化计数(mnc)值加1,并将总和转化成对数(log2)以得到log2[mnc+1]值(表15)。将log2[mnc+1]值用于分析抗体-药物缀合物(1)在每位患者中的抗肿瘤活性(表14)与htrop2基因和slfn11基因的表达量之间的关系。当所有评价的患者被分组到具有htrop2和slfn11基因的至少某种表达量的组中时(表16),显示随着htrop2基因表达和slfn11基因表达增加,显示出至少某种药物效力(0%或更低的最大肿瘤变化率)的患者的比例更高(表17)。在没有通过slfn11基因表达分组存在下,显示出0%或更低的最大肿瘤变化率的患者的比例不超过75-80%。因而,揭示了htrop2基因表达量和slfn11基因表达量的组合可以用作敏感性标志物来预测抗体-药物缀合物(1)的抗肿瘤作用。例如,当htrop2基因的log2[mnc+1]值超过12且slfn11基因的log2[mnc+1]值超过11.5时,其中最大肿瘤变化率为0%或更低的患者的比例是约80%至100%。[表14]抗体-药物缀合物(1)在每位患者中的抗肿瘤活性(最大肿瘤变化率)患者id抗体-药物缀合物剂量(mg/kg)最大肿瘤变化率(%)#12-7.14#22-68.52#32-4.76#42-11.70#5252.00#623.15#7433.33#84-53.13#96-52.27#108-3.47#118-35.46#128-63.64[表15]每位患者中的htrop2基因和slfn11基因表达患者idhtrop2基因表达量(log2[mnc+1])slfn11基因表达量(log2[mnc+1])#114.3213.13#214.3412.32#312.9412.32#414.8012.90#512.5511.35#616.5912.25#710.1011.69#811.3512.24#912.1412.73#1011.5613.28#1115.1811.99#1213.0812.85[表16]具有htrop2基因和slfn11基因的至少某种表达量的患者的数目[表17]在具有htrop2基因和slfn11基因的至少某种表达量的患者中显示出抗体-药物缀合物(1)的0%或更低的最大肿瘤变化率的患者的比例序列表的自由正文seqidno:1:人源化的抗-htrop2抗体的重链的氨基酸序列seqidno:2:人源化的抗-htrop2抗体的轻链的氨基酸序列seqidno:3:人源化的抗-htrop2抗体的重链的cdrh1序列seqidno:4:人源化的抗-htrop2抗体的重链的cdrh2序列seqidno:5:人源化的抗-htrop2抗体的重链的cdrh3序列seqidno:6:人源化的抗-htrop2抗体的轻链的cdrl1序列seqidno:7:人源化的抗-htrop2抗体的轻链的cdrl2序列seqidno:8:人源化的抗-htrop2抗体的轻链的cdrl3序列。当前第1页1 2 3 
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